1、农业防治
经常保持果园清洁，及时清扫残枝落叶、剪除病虫枝果，集中烧毁或深埋。当发现树干有新虫粪时用天牛勾杀器把幼虫勾出直接杀死。9月份用麦草或稻草在果树主干部位绑起来，诱导其在内化蛹越冬，来年春季再将草取掉烧毁。冬季用泥土填树洞，刮树皮，清除虫源，树干涂白。
2、化学防治
在第1代幼虫孵化期、5月中旬成虫发生期、5月下旬卵盛期，用2.5%天王星乳油或30%桃小净1 500倍液树冠喷雾2～3次，间隔10～15 d。7月下旬、8月上旬是第2代幼虫防治的最佳时期，用菊酯类农药、乐斯本等防治。发现树干有新虫粪时，用一次性注射器注射药物50倍氯氰菊酯或10倍毒死蜱等，注满药物后插上一节小树枝；也可用毒棉签直接塞进树洞进行防治。
3、生物防治
每1 hm2挂1个苹果钻心虫性诱杀器，诱杀雄成虫，控制其危害。
4、物理防治
利用苹果钻心虫成虫的趋光性，诱杀成虫。5月上旬至9月上旬，每1～1.3 hm2果园安装一台频振式杀虫灯，诱杀苹果钻心虫成虫。
